Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms