Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PtprnQ60673 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms