Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms