Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms