Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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