Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms