Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm29609Q3UU56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm29609Q3UU56 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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