Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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