Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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