Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms