Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccbe1Q3MI99 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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