Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rpusd2Q149F1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rpusd2Q149F1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rpusd2Q149F1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms