Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Traf3ip1Q149C2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Traf3ip1Q149C2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Traf3ip1Q149C2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Traf3ip1Q149C2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Traf3ip1Q149C2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Traf3ip1Q149C2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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