Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MestQ07646 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MestQ07646 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MestQ07646 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms