Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms