Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms