Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms