Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms