Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms