Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms