Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms