Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabpb1Q00420 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabpb1Q00420 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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