Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcc1P97496 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms