Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms