Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AgrpP56473 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AgrpP56473 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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