Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Aqp4P55088 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms