Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Efna1P52793 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efna1P52793 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms