Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClgnP52194 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms