Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FmodP50608 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms