Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms