Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbx1P41778 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbx1P41778 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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