Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms