Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpardP35396 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpardP35396 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpardP35396 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpardP35396 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpardP35396 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpardP35396 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpardP35396 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpardP35396 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms