Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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