Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb3P28231 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb3P28231 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms