Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pde6aP27664 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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