Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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