Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrphP15331 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrphP15331 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrphP15331 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms