Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms