Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nsd1O88491 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nsd1O88491 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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