Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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CrxO54751 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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CrxO54751 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CrxO54751 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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