Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm44O35857 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timm44O35857 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms