Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stag2O35638 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stag2O35638 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms