Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ebf1-201ENSMUST00000081265 5981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms