Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm340F6RGI3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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