Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms