Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim12cD3Z3L3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms