Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms