Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clrn2B2RVW2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms