Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms